| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sul. |
|
Data corrente: |
29/03/2011 |
|
Data da última atualização: |
26/02/2024 |
|
Tipo da produção científica: |
Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
|
Autoria: |
HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; IBELLI, A. M. G.; REGITANO, L. C. de A.; CARDOSO, F. F. |
|
Afiliação: |
ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; ADRIANA MÉRCIA GUARATINI IBELLI, Bolsista Capes, CNPTIA; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL. |
|
Título: |
Análise de agrupamento de dados de expressão gênica na Rede Genômica Animal. |
|
Ano de publicação: |
2010 |
|
Fonte/Imprenta: |
Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. |
|
Páginas: |
11 p. |
|
Série: |
(Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 101). |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho é apresentar a análise de agrupamento de dados de expressão gênica, conforme realizada no escopo da ?Rede Genômica Animal?. Na seção 2, são apresentados conceitos básicos sobre análises de agrupamento. Em particular, os algoritmos de agrupamento utilizados nessas análises compreendem aqueles mais conhecidos, como k-means, SOM e agrupamento hierárquico. A plataforma de análise escolhida para realização das análises de agrupamento na ?Rede Genômica Animal? é o ambiente de análise estatística R (R DEVELOPMENT CORE TEAM, 2010) e o projeto Bioconductor (GENTLEMAN et al., 2004). Assim, na seção 3 é apresentado um exemplo completo de análise de agrupamento e seu respectivo script R. |
|
Palavras-Chave: |
Agrupamento de dados; Análise de componentes principais; Expressão gênica; PCA; Rede Genômica Animal. |
|
Thesagro: |
Análise Estatística. |
|
Thesaurus Nal: |
Algorithms; Gene expression; Principal component analysis; Statistical analysis. |
|
Categoria do assunto: |
--
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/32433/1/ct101-10-4.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 01721nam a2200313 a 4500
001 1883623
005 2024-02-26
008 2010 bl uuuu u0uu1 u #d
100 1 $aHIGA, R. H.
245 $aAnálise de agrupamento de dados de expressão gênica na Rede Genômica Animal.$h[electronic resource]
260 $aCampinas: Embrapa Informática Agropecuária$c2010
300 $a11 p.
490 $a(Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 101).
520 $aO objetivo deste trabalho é apresentar a análise de agrupamento de dados de expressão gênica, conforme realizada no escopo da ?Rede Genômica Animal?. Na seção 2, são apresentados conceitos básicos sobre análises de agrupamento. Em particular, os algoritmos de agrupamento utilizados nessas análises compreendem aqueles mais conhecidos, como k-means, SOM e agrupamento hierárquico. A plataforma de análise escolhida para realização das análises de agrupamento na ?Rede Genômica Animal? é o ambiente de análise estatística R (R DEVELOPMENT CORE TEAM, 2010) e o projeto Bioconductor (GENTLEMAN et al., 2004). Assim, na seção 3 é apresentado um exemplo completo de análise de agrupamento e seu respectivo script R.
650 $aAlgorithms
650 $aGene expression
650 $aPrincipal component analysis
650 $aStatistical analysis
650 $aAnálise Estatística
653 $aAgrupamento de dados
653 $aAnálise de componentes principais
653 $aExpressão gênica
653 $aPCA
653 $aRede Genômica Animal
700 1 $aGIACHETTO, P. F.
700 1 $aYAMAGISHI, M. E. B.
700 1 $aIBELLI, A. M. G.
700 1 $aREGITANO, L. C. de A.
700 1 $aCARDOSO, F. F.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 41 | |
| 24. |  | TAVARES, P. F. de S.; GONÇALVES, J. S.; COELHO, R. S.; PARANHOS, B. A. J.; GAVA, C. A. T. Efeito de conservantes antimicrobianos usados em dietas de moscas-das-frutas sobre a virulência de isolados de Beauveria bassiana (Bals.) Vuill. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 7.; JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA FACEPE/UNIVASF, 1., 2012, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2012. p. 321-327. 1 CD-ROM. (Embrapa Semiárido. Documentos, 248).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
|    |
| 28. | | SILVA, L. L. da; AMANCIO, C. O. da G.; TAVARES, P. D.; AMANCIO, R.; GAROFOLO, A. C. S. Reflexões sobre métodos de extensão rural através da análise de eventos para transferência de tecnologias em uma unidade da Embrapa. In: CONGRESSO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ECONOMIA, ADMINISTRAÇÃO E SOCIOLOGIA RURAL, 52., 2014, Goiânia. Heterogeneidade e suas implicações no rural brasileiro: anais. Goiânia: Sober, 2014. não paginado. Sober 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
| |
| 29. | | TAVARES, P. D.; SILVA, C. F. da; PEREIRA, M. G.; FREO, V. A.; BIELUCZYK, W.; SILVA, E. M. R. da. Soil quality under agroforestry systems and traditional agriculture in the atlantic forest biome. Revista Caatinga, v. 31, n. 4, p. 954 ? 962, out./dez., 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
| |
| 30. | | TAVARES, P. D.; SILVA, C. F. da; PEREIRA, M. G.; FREO, V.; SILVA, E. M. R. da. Sistemas agroflorestais e agricultura tradicional promovendo a qualidade do solo na Mata Atlântica Cadernos de Agroecologia, v 10, n. , p. 1-6, 2015 Trabalho apresentado no IX Congresso Brasileiro de Agroecologia - Belém, 2015| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
| |
| 31. | | DUARTE, N. C.; TAVARES, P. F. de S.; ALVES, I. L. de S.; LIMA, J. de S.; GAVA, C. A. T. Aplicação de isolados de leveduras para o controle de podridões pós-colheita em manga cv. Kent. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 11., 2016, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2016. p. 73-78. (Embrapa Semiárido. Documentos, 271).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
| 32. | | DUARTE, N. C.; TAVARES, P. F. de S.; ALVES, I. L. de S.; LIMA, J. de S.; GAVA, C. A. T. Aplicação pré-colheita de leveduras para o controle de podridões pós-colheita de manga Kent. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 11., 2016, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2016. p. 67-72. (Embrapa Semiárido. Documentos, 271).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
| 33. | | RAMOS, N. S. P. L.; SOUTO, B. de M.; SANTANA, B. G.; TAVARES, P.; CUNHA, I. S.; KRUGER, R.; QUIRINO, B. F. Bioprospection of clones with endoglucosidase and xylanase activities from a goat rumen metagenomic library. In: BRAZILIAN BIOENERGY SCIENCE AND TECHNOLOGY CONFERENCE - BBEST, 1., 2011, Campos do Jordão, SP. [Anais...]. São Paulo: FAPESP, 2011. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
| |
| 34. | | CONCEIÇÃO, G. C. da; GAVA, C. A. T.; TAVARES, P. F. S.; JESUS, T. S. de; SOUZA, L. S. B.; FERNANDES JUNIOR, P. I.; GIONGO, V. Influência da cobertura vegetal sobre a atividade microbiana em um Cambissolo sob diferentes usos em Irecê, BA. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 8., 2013, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2013. p. 119-125. (Embrapa Semiárido. Documento, 253).s| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
| 35. | | ALVES, I. L. de S.; TAVARES, P. F. de S.; LIMA, J. de S.; DUARTE, N. C.; GAVA, C. A. T. Hidrolisado de proteína de soja em meio de cultivo para a produção de agente de controle biológico. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 11., 2016, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2016. p. 55-60. (embrapa Semiárido. Documentos, 271).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
| 36. | | BERGMANN, J. C.; BOARI, A. de J.; KRUGER, R. H.; TAVARES P.; TOGAWA, R. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; PAPPAS JUNIOR, G. J.; QUIRINO, B. F. New strategies to look at old problems: fatal yellowing in palm oil tree. In: BRAZILIAN BIOENERGY SCIENCE AND TECHNOLOGY CONFERENCE - BBEST, 1., 2011, Campos do Jordão, SP. [Anais...]. São Paulo: FAPESP, 2011. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 37. | | BERGMANN, J. C.; BOARI, A. de J.; KRUGER, R. H.; TAVARES, P.; TOGAWA, R. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; PAPPAS JUNIOR, G. J.; QUIRINO, B. F. New strategies to look at old problems: fatal yellowing in palm oil tree. In: BRAZILIAN BIOENERGY SCIENCE AND TECHNOLOGY CONFERENCE - BBEST, 1., 2011, Campos do Jordão, SP. [Anais...]. São Paulo: FAPESP, 2011. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| 38. | | ROSSI, L. C.; BERENGUER, E.; LEES, A. C.; BARLOW, J.; FERREIRA, J. N.; FRANÇA, F. M.; TAVARES, P.; PIZO, M. A. Predation on artificial caterpillars following understorey fires in human-modified Amazonian forests. Biotropica, v. 54, n. 3, p. 754-763, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
|  |
| 39. | | GONÇALVES, J. S.; TAVARES, P. F. S.; GAVA, C. A. T.; ARAÚJO, L. F. C.; CASTRO, A. P. C.; PEREIRA, C. A. Tolerância de conídios de isolados de Beauveria bassiana (Balsam) Vuill. a radiação UV e temperatura. In: SIMPÓSIO DE CONTROLE BIOLÓGICO, 13., 2013, Bonito. Faça bonito: use controle biológico: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2013. 1 CD-ROM. SICONBIOL 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
| 40. | | ALVES, I. L. de S.; LIMA, J. de S.; DUARTE, N. C.; TAVARES, P. F. de S.; GAVA, C. A. T. Tolerância de isolados de levedura a elevadas temperaturas e baixo potencial osmótico. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 11., 2016, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2016. p. 61-66. (Embrapa Semiárido. Documentos, 271),| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
| Registros recuperados : 41 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
